فلش‌کارت‌های آموزشی مونتایژ ژنوم گونه‌های دریایی: روش‌های پیشرفته و کاربردی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره مونتایژ ژنوم گونه‌های دریایی: روش‌های پیشرفته و کاربردی

موضوع کلی: بیوتکنولوژی دریایی

موضوع میانی: استراتژی‌های مونتایژ ژنوم گونه‌های دریایی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه به مونتایژ ژنوم گونه‌های دریایی
• 2. مجموعه‌های داده ژنومیک دریایی و منابع
• 3. پیش‌پردازش توالی‌ها: کیفیت‌بخشی و اصلاح
• 4. انتخاب طول کانتور و پارامترهای کلید
• 5. الگوریتم‌های مونتایژ خطی
• 6. الگوریتم‌های مونتایژ گراف
• 7. مونتایژ نسل دوم (Short-Read) برای گونه‌های دریایی
• 8. مونتایژ نسل سوم (Long-Read) برای گونه‌های دریایی
• 9. ترکیب خوانده‌ها از پلتفرم‌های مختلف (Hybrid Assembly)
• 10. مدیریت توالی‌های تکراری در ژنوم‌های دریایی
• 11. نقشه‌برداری و اصلاح ژنوم
• 12. اعتبارسنجی کیفیت مونتایژ
• 13. اندازه‌گیری و تجزیه و تحلیل طول کانتور
• 14. ابزارهای نرم‌افزاری برای مونتایژ دریایی
• 15. مونتاژ خودکار با اسکریپت‌های پایتون
• 16. استفاده از کلاسترهای محلی برای مونتایژ
• 17. مونتایزاسیون گونه‌های دریایی نادر
• 18. مدیریت داده‌های بزرگ ژنومیک
• 19. پارالelizاسیون و محاسبات ابری برای مونتایژ
• 20. استراتژی‌های مونتاژ برای گونه‌های با ژنوم بزرگ
• 21. مونتایژ ژنوم‌های پلی‌پلوید
• 22. کاربردهای مونتایژ دریایی در حفاظت از گونه‌ها
• 23. کاربردهای مونتایژ دریایی در زیست‌شناسی تطابقی
• 24. مونتاژ ژنوم‌های نمونه‌ای: مثال‌های عملی
• 25. ساخت یک پشتهٔ آموزشی مونتایژ ژنوم دریایی
• 26. طراحی آزمایش‌های عملی برای مونتایژ
• 27. ارزیابی و تفسیر نتایج مونتایژ
• 28. راه‌حل‌های خطا و چالش‌های رایج
• 29. آیندهٔ مونتایژ ژنوم دریایی: فن‌آوری‌های نوین
• 30. منابع و کتاب‌های پیشنهادی
• 31. مقدمه به بیت‌اسکریپت‌های مونتایژ
• 32. نوشتن اسکریپت‌های مونتایژ با Snakemake
• 33. اجرای مونتاژ روی سوپرکامپیوترهای HPC
• 34. بهینه‌سازی حافظه برای مونتایژ
• 35. استفاده از GPU برای تسریع مونتاژ
• 36. مدیریت کانتینرهای داکر برای مونتایژ
• 37. یکپارچه‌سازی با NCBI Genome Database
• 38. استانداردسازی فرمت‌های توالی
• 39. اصلاح توالی‌های رونویسی
• 40. مونتایژ رونویسی‌های دریایی
• 41. شناسایی ژن در ژنوم‌های مونتاژشده
• 42. یکپارچه‌سازی داده‌های ترانسکریپتوم و ژنوم
• 43. بررسی عملکرد ابزارهای مونتایژ
• 44. مقایسهٔ الگوریتم‌های مونتایز
• 45. ساخت یک پشتهٔ مونتایز برای داده‌های متاژنومیک
• 46. کشف گونه‌های جدید از طریق مونتاژ
• 47. مدیریت داده‌های حاصل از دستگاه‌های نسل سوم
• 48. فیلتر کردن خوانده‌های باکیفیت
• 49. اصلاح توالی‌های بلند
• 50. مونتاژ با استفاده از کانتورهای هگزا
• 51. کار با کانتورهای adapt
• 52. تشخیص و حذف توالی‌های کنترمینال
• 53. ساخت اسکافولدهای قابل انطباق
• 54. نقشه‌برداری ژنومیک با استفاده از داده‌های RID
• 55. کاربردهای مونتاژ در زیست‌شناسی دریایی همگن
• 56. استفاده از مونتاژ برای مطالعهٔ گونه‌های تهیدست
• 57. آموزش مونتایژ در کلاس‌های کارگاهی
• 58. توسعهٔ محتوای دورهٔ آنلاین
• 59. طراحی ارزیابی‌های پس از دوره
• 60. شبکه‌سازی حرفه‌ای برای دانشجویان مونتایژ