فلش‌کارت‌های آموزشی تحلیل داده‌های Whole Genome Sequencing

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل داده‌های Whole Genome Sequencing

موضوع کلی: زیست‌شناسی و مهندسی ژنتیک

موضوع میانی: آنالیز داده‌های NGS

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر توالی‌یابی کل ژنوم
• 2. اصول زیست‌شناسی مولکولی در توالی‌یابی کل ژنوم
• 3. نسل‌های توالی‌یابی DNA
• 4. توالی‌یابی نسل اول (سانگر)
• 5. توالی‌یابی نسل دوم (NGS): اصول و کاربردها
• 6. پلتفرم‌های توالی‌یابی NGS: Illumina، Ion Torrent، PacBio
• 7. توالی‌یابی کل ژنوم با Illumina: مراحل و تحلیل
• 8. توالی‌یابی کل ژنوم با PacBio: مزایا و محدودیت‌ها
• 9. کیفیت داده‌های توالی‌یابی: ارزیابی و کنترل
• 10. پاکسازی و فیلتر کردن داده‌های توالی‌یابی
• 11. هم‌ترازی (Alignment) توالی‌ها به ژنوم مرجع
• 12. فرمت‌های فایل‌های توالی‌یابی (FASTQ، BAM، VCF)
• 13. شناسایی تنوع ژنتیکی: SNPs، Indels
• 14. شناسایی تغییرات ساختاری (Structural Variations)
• 15. تحلیل واریانت‌ها: تفسیر بالینی و اهمیت
• 16. ژنوتایپینگ و فنوتیپینگ با استفاده از WGS
• 17. مطالعات ارتباط ژنوم گسترده (GWAS)
• 18. توالی‌یابی اگزوم (Exome Sequencing) در مقابل توالی‌یابی کل ژنوم
• 19. کاربرد WGS در تشخیص بیماری‌های ژنتیکی
• 20. کاربرد WGS در سرطان‌شناسی: شناسایی جهش‌های سرطانی
• 21. کاربرد WGS در داروشناسی (Pharmacogenomics)
• 22. کاربرد WGS در مطالعه میکروارگانیسم‌ها
• 23. آنالیز متاژنومیک با استفاده از WGS
• 24. توالی‌یابی RNA (RNA-Seq) و ارتباط آن با WGS
• 25. تفسیر داده‌های RNA-Seq برای تعیین بیان ژن
• 26. ادغام داده‌های WGS و RNA-Seq
• 27. تحلیل مسیرهای متابولیکی با استفاده از WGS
• 28. توالی‌یابی کل ژنوم در پزشکی شخصی
• 29. آینده توالی‌یابی کل ژنوم و کاربردهای نوظهور
• 30. چالش‌های اخلاقی و حقوقی توالی‌یابی کل ژنوم
• 31. محافظت از حریم خصوصی داده‌های ژنتیکی
• 32. ملاحظات آماری در تحلیل داده‌های WGS
• 33. نرم‌افزارهای رایج در تحلیل داده‌های WGS
• 34. پایگاه‌های داده ژنتیکی و منابع آنلاین
• 35. کنترل کیفیت در آزمایشگاه‌های توالی‌یابی
• 36. آماده‌سازی نمونه برای توالی‌یابی کل ژنوم
• 37. روش‌های استخراج DNA با کیفیت بالا
• 38. کتابخانه‌های DNA: ساخت و انتخاب
• 39. تکنیک‌های PCR در توالی‌یابی
• 40. توالی‌یابی متاژنومیک محیط زیست
• 41. توالی‌یابی کل ژنوم در کشاورزی و اصلاح نباتات
• 42. توالی‌یابی کل ژنوم در دامپروری و انتخاب نژاد
• 43. تحلیل ژنتیکی جمعیت‌ها با استفاده از WGS
• 44. شناسایی جهش‌های بیماری‌زا با استفاده از WGS
• 45. توالی‌یابی کل ژنوم بیماران نادر
• 46. ارتباط بین واریانت‌های ژنتیکی و پاسخ به درمان
• 47. تحلیل داده‌های WGS برای پیش‌بینی خطر ابتلا به بیماری
• 48. توالی‌یابی کل ژنوم در تحقیقات تکاملی
• 49. توالی‌یابی کل ژنوم ویروس‌ها و ارزیابی شیوع آن‌ها
• 50. کاربرد WGS در تشخیص عفونت‌های بیمارستانی
• 51. تحلیل داده‌های WGS برای شناسایی مقاومت آنتی‌بیوتیکی
• 52. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه تنوع ژنتیکی انسان
• 53. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی ریشه‌های قومی
• 54. تحلیل داده‌های WGS برای شناسایی ژن‌های مرتبط با صفات پیچیده
• 55. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های خودایمنی
• 56. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی اثرات عوامل محیطی بر ژنوم
• 57. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه پیری و طول عمر
• 58. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های عصبی
• 59. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های قلبی عروقی
• 60. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های تنفسی
• 61. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های گوارشی
• 62. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های پوستی
• 63. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های چشمی
• 64. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های خونی
• 65. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های غدد درون‌ریز
• 66. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های کلیوی
• 67. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های عفونی
• 68. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های روانی
• 69. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های ایمنی
• 70. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های متابولیک
• 71. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های نورولوژیک
• 72. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های ژنتیکی نادر
• 73. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های پوستی ارثی
• 74. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های قلبی مادرزادی
• 75. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های عصبی عضلانی
• 76. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های تنفسی ارثی
• 77. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های خونی ارثی
• 78. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های گوارشی ارثی
• 79. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های کلیوی ارثی
• 80. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های غدد درون‌ریز ارثی
• 81. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های ایمنی ارثی
• 82. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های متابولیک ارثی
• 83. توالی‌یابی کل ژنوم و مطالعه بیماری‌های روانی ارثی
• 84. توالی‌یابی کل ژنوم و بررسی بیماری‌های نورولوژیک ارثی