اپلیکیشن اندرویدی فلش‌کارت آموزشی Drop-seq در ژنتیک ماهی زبرا و ارگانیسم‌های مدل

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره Drop-seq در ژنتیک ماهی زبرا و ارگانیسم‌های مدل

موضوع کلی: بیولوژی مولکولی و ژنتیک

موضوع میانی: تکنیک‌های ژنومیکس تک‌سلولی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر ژنومیکس تک‌سلولی و اهمیت آن
• 2. کاربردهای ژنومیکس تک‌سلولی در ارگانیسم‌های مدل
• 3. معرفی روش Drop-seq: اصول و مبانی
• 4. تفاوت‌های Drop-seq با سایر روش‌های ژنومیکس تک‌سلولی
• 5. تهیه نمونه برای Drop-seq در ماهی زبرا
• 6. ایزوله کردن هسته (Nuclei Isolation) از بافت ماهی زبرا
• 7. برچسب‌گذاری هسته‌ها با بارکدها (Barcoding)
• 8. امولسیفیکاسیون و ایجاد قطرات (Droplet Generation)
• 9. تکثیر PCR و آماده‌سازی کتابخانه DNA
• 10. توالی‌یابی نسل جدید (NGS) و داده‌های خروجی Drop-seq
• 11. کنترل کیفیت داده‌های Drop-seq
• 12. پیش‌پردازش داده‌های Drop-seq: حذف داده‌های نامرغوب
• 13. هم‌ترازی داده‌ها (Alignment) با ژنوم مرجع ماهی زبرا
• 14. شمارش بیان ژن‌ها (Gene Expression Quantification)
• 15. نرم‌افزارهای تحلیل داده Drop-seq: معرفی و مقایسه
• 16. تجزیه و تحلیل داده‌های Drop-seq: شناسایی جمعیت‌های سلولی
• 17. خوشه‌بندی سلول‌ها (Cell Clustering) بر اساس پروفایل بیان ژن
• 18. آنالیز تفاضلی بیان ژن (Differential Gene Expression Analysis)
• 19. تجسم داده‌های Drop-seq: استفاده از ابزارهای بصری‌سازی
• 20. شناسایی مارکرهای سلولی (Cell Markers)
• 21. اعتبارسنجی نتایج Drop-seq با روش‌های دیگر (qPCR, Flow Cytometry)
• 22. بررسی تغییرات تک‌نوکلئوتیدی (SNVs) با استفاده از Drop-seq
• 23. تحلیل کپی نامبر (Copy Number Variation) با Drop-seq
• 24. شناسایی RNA ویروسی در سلول‌های ماهی زبرا با Drop-seq
• 25. کاربرد Drop-seq در مطالعه تکامل جنینی ماهی زبرا
• 26. بررسی پاسخ ایمنی ماهی زبرا به عفونت با Drop-seq
• 27. مطالعه تومورزایی و متاستاز با استفاده از Drop-seq در مدل‌های ماهی زبرا
• 28. آنالیز تغییرات اپی‌ژنتیکی با Drop-seq
• 29. ایجاد اطلس سلولی ماهی زبرا با Drop-seq
• 30. محدودیت‌های Drop-seq و راهکارهای غلبه بر آن‌ها
• 31. بهینه‌سازی پروتکل Drop-seq برای ارگانیسم‌های مدل مختلف
• 32. طراحی آزمایش‌های Drop-seq: ملاحظات مهم
• 33. آینده Drop-seq و تکنیک‌های نوین ژنومیکس تک‌سلولی